南京目前只有4家经批准开展人类辅助生殖医院，其中就包括江苏省人民医院、南京鼓楼医院、南京市妇幼保健院以及东部战区总医院，而这些试管医院除了一代、二代试管之外，均开展第三代供卵试管婴儿辅助生殖技术，并且这些医院不论是试管成功率、综合水平实力等方面都是差距不大的，所以不孕不育患者可以根据自己的实际情况，选择任何一家医院去做三代供卵试管婴儿都是比较不错的。

在国内针对三代供卵试管婴儿的实施是有十分严格规定的，截止到目前国内70家医院是可以开展三代试管婴儿的，其中在南京只有四家医院，同时由于供卵试管的卵裂比较紧张，因此在南京做供卵3代试管婴儿可能还需要等待1-3年左右的卵源，具体时间因人而异，不过在南京的这几家试管医院的成功率还是不错的。

1、江苏省人民医院

该院配备有先进的医疗设备、经验丰富的医护团队及技术精湛的胚胎专家，可以完成各种试管婴儿技术，其供卵三代试管成功率在60%左右，地址位于南京市鼓楼区广州路300号。

2、南京鼓楼医院

该院的生殖中心利用三代试管婴儿技术，成功在该中心诞生了国内首例阻断CCA及SBMA遗传病试管婴儿，其供卵三代试管的成功率在60%左右，地址位于南京市鼓楼区中山路348号10楼。

3、南京市妇幼保健院

该院生殖中拥有层流净化手术室、胚胎培养室及ICSI操作室，其供卵三代试管成功率在50%-60%左右，地址位于南京市秦淮区莫愁路天妃巷123号。

4、东部战区总医院

拥有开展人类辅助生殖技术的全部资质，还包括了妇科和男科不孕不育症的临床诊疗工作以及辅助生殖技术等等，其供卵三代试管成功率在50%-60%左右，地址位于南京市秦淮区杨公井34标34号

总的来说，在南京做第三代供卵试管婴儿最好的医院当属江苏省人民医院和南京鼓楼医院，而这两家医院除了试管成功率比较高之外，在南京当地都是很有名的医院，不过另外两家试管医院也都是不错的，都是值得大家选择的医院。