通常情况下，女性在做完囊胚移植手术26天后，胚胎已经自然着床，这之后的激素变化会刺激女性子宫内膜，导致肚子左侧隐隐作痛并且有褐色的血流出，属于正常生理因素，不用过于担忧。但是每个女性情况不同，无法一概而论，也可能是胚胎着床不稳或者异位妊娠等原因导致肚子左侧隐隐作痛伴随出血，需要前往医院进行检查，才能得到准确的原因。

囊胚移植26天女性进入孕期，会出现各种不同的症状，有的疲惫乏力、恶心呕吐，有的小腹坠胀、乳房疼痛，其中也不乏有腹痛出血现象的女性，这种情况只需要好好休养，保持营养充足即可。除此之外，女性在术后26天肚子左侧隐隐作痛，并且有褐色血流出的原因还有：

• 子宫收缩：有些女性在囊胚移植后，长期精神状态紧绷刺激子宫收缩，这时就会出现肚子左侧隐隐作痛，如果子宫收缩明显会使胚胎出现先兆流产，因此有褐色的血流出；
• 异位妊娠：如果在囊胚移植后，胚胎游走到左侧的输卵管出现异位妊娠，随着胚胎发育，左侧输卵管破裂，也会导致女性感觉肚子左侧隐隐作痛，并且还伴有褐色的血；
• 着床不稳：一部分女性在手术成功后营养摄入不均衡，胚胎吸收不到足够的营养，就会着床不稳导致出血，较为敏感的女性在这时同样会感觉到肚子左侧隐隐作痛。

因此，女性在囊胚移植26天肚子左侧隐隐作痛，并且有褐色的血流出原因有很多，需要根据女性具体情况来判断。建议女性出现不适后立即前往医院就医，以免延误病情，对胚胎造成不可挽回的伤害。