染色体azfc缺失不做三代试管筛查，不一定会遗传。因为染色体azfc缺失是指男性Y染色体AZFc基因缺失，这种情况会导致男性不育，由于AZF这个基因存在于男性的Y染色体上，所以如果生的是男孩的话，那么就一定会遗传到男孩的身上，若是生的女孩就不会则遗传下去。因此，染色体azfc缺失缺失只会遗传男孩，若是不做三代试管筛查，生出的宝宝是女孩的话，就不会遗传。

由于染色体azfc缺失只会遗传给男孩，并不会遗传给女孩，所以就算是染色体azfc缺失不做三代试管筛查，遗传给后代的几率也只有50%，并不是一定就会遗传到。但由于染色体azfc缺失自然怀孕的几率很低，因为染色体AZFc缺失可表现为无精子症或严重少、弱精子症，并随着年龄的增长呈加重趋势，所以染色体azfc缺失的患者想要孩子，本着优生优育的原则，最好还是做三代试管筛查最好，同时也可以降低孩子遗传到染色体azfc缺失的风险。

染色体azfc缺失是一种基因疾病，众所周知基因疾病是有一定遗传性的，并且这是一种男传男的遗传病，若是染色体azfc缺失患者想要一个男宝宝的话，就必须做三代试管的基因筛查。由于男性染色体azfc缺失，精子数量可能会随着年龄的增长变得越来越少，从少精症直至变为无精症，所以患有染色体azfc缺失症状的男性一定要尽早生育，或是先冷冻精子保守治疗。