胚胎保存在零下196摄氏度的液氮里并不会冻坏，因为在胚胎冷冻前，医院的医生会将胚胎放入专门的冷冻保护剂中，将胚胎内的水分吸干，避免因为水分过多而导致胚胎内出现结晶，导致胚胎受损。之后再将混入冷冻保护剂的胚胎放入零下196摄氏度的液氮中进行储存，这时胚胎的细胞会处于“休眠”状态，可在这样的条件下储存10年甚至是20年以上的时间。

从理论上来说，在零下196℃液氮冷冻状态下，会让液氮中细胞酶的活力几乎完全受到抑制，从而让细胞进程处于“休眠”状态，这样的条件下冷冻胚胎是可以无限期保存的。不过根据大量临床数据证明，5年以内的冷冻胚胎，胚胎复苏后的存活率、试管妊娠成功几率以及出生缺陷率不会有负面影响。也就是说，冷冻保存时间超过5年有可能存在不良影响。因此，胚胎经过漫长的冷冻后，等待解冻之时，胚胎是否还能复苏，以及是否存在后代缺陷的风险，目前也是无法推断的。

现在比较常用的是玻璃化冷冻，是将胚胎放置于冷冻保护液中，装入冷冻管内，经过慢速或快速降温方式使胚胎将至极低温度，暂时不会生长发育，并在-196℃的液氮中长期休眠保存，长可达十多年甚至数十年。所以患者不需要过多的担心胚胎的冷冻过程和冷冻时间的长短，这些对胚胎的质量没有任何影响，胚胎的质量也不会因为冷冻而变得不好。