43岁女性做三代试管婴儿筛查胚胎后，畸形率就不是很高了。因为三代试管婴儿的胚胎筛查技术，可以把有问题的基因及染色体的胚胎排除，移植正常的胚胎，从而使高龄女性生出畸形儿的风险降低。但由于造成胎儿畸形的原因有很多，除开基因问题和染色体问题外，生活环境、母体病毒感染等都会导致胎儿畸形。因此，建议43岁女性做三代试管婴儿怀孕后，还是要定期做好产检，避免生出畸形儿。

随着试管婴儿技术的发展，第三代试管婴儿的出现，帮助了越来越多有遗传疾病的家庭，生出了健康的宝宝，做到了优生优育。由女性在35岁以后，卵巢功能就开始衰弱了，并且卵子的数量以及质量都随着年龄的增长而变少变差。所以若是女性在43岁时自然怀孕生宝宝的话，那么胎儿出现畸形的几率会很高。若是43岁女性做三代试管婴儿筛查胚胎后再移植怀孕，那么就可以大大的降低胎儿的畸形率。所以，43岁女性做三代试管婴儿筛查胚胎后，畸形率并不高。

据统计，试管婴儿的成功率约为60%，但40岁以上的女性试管成功率不超过20%，当然由于每个女性的身体情况不同，所以试管成功率也会有所不同。当43岁女性做三代试管婴儿筛查胚胎后，其胎儿的畸形率就会降低，但毕竟三代试管婴儿基因筛查技术，无法保证出生的宝宝100%是健康的，并且与自然怀玉一样，宝宝会在母亲的肚子里待十个月，在这期间就有可能会受到外界的影响，所以43岁女性在怀孕期间一定要做好孕期检查，避免宝宝后出现异常情况。