男方y染色体微缺失生育有一定的障碍，一般不能正常生育后代。存在Y染色体微缺失的男性，其父亲可能也存在Y染色体微缺失，遗传是主要因素。男方y染色体微缺失生了儿子有可能几乎没有影响，也可能存在一些问题，比如可能导致无精子症、少精子症和弱精子症。所以这类人群不建议自然怀孕，可以选择是第三代试管婴儿助孕生子。

y染色体微缺失生下男孩会有什么问题：

其实男性的性染色体，Y染色体上面存在一种特殊的因子，即无精子因子。大部分染色体微缺失的人不会影响到正常的生活，不过生下生下男孩也可能会导致出现以下问题。

• y染色体微缺失，对男性生育造成的影响差异也比较大；
• 因为染色体的微缺失，存在很多种类型，有一些类型几乎是没有影响的，不会造成任何的临床症状；
• 有一些微缺失造成的影响是比较大的，会引起睾丸的不发育或者发育不良，不能产生精子或者产生的精子有功能障碍；

男方y染色体微缺失生了儿子有没有问题其实要看具体的症状，有的几乎没有影响。部分患者生了儿子如果被遗传了，可能会造成男性不育，主要表现为无精子症、少精子症和弱精子症，当然除了生育方面，其他方面是没有影响的。通常，建议男方存在y染色体微缺失的情况通过第三代试管婴儿技术助孕生子，三代试管可筛查125种遗传疾病，帮助患者生健康孩子。