男方Y染色体异常，是不可以做二代试管避免下一代遗传的。二代试管主要是针对男性不育问题的，如少精、弱精等症状，通过卵细胞浆内单精子注射技术，起到辅助生育的效果，却无法避免下一代遗传。通常男性染色体出现问题的话，都是建议做第三代试管婴儿的，通过三代试管的PGD和PGS筛查技术，在胚胎移植前对其进行筛查，选择出正常健康的胚胎进行移植，从而做到优生优育，避免下一代遗传。

临床上，常见的Y染色体异常有三种情况，分别是azfa、azfb、azfc缺失，这些情况会影响到睾丸的神经功能，导致男性出现无精子症或者重度少精子症等情况，进而影响到男性的正常生育功能。而对于有生育要求的患者，就需要通过试管婴儿或者是其他辅助生殖方式来获得后代。而为了优生优育，一般都是建议患者做三代试管婴儿，从而解决染色体异常夫妻怀孕生育的问题。

通常男性Y染色体异常是无法通过药物进行治疗的，一般都是建议该类患者早婚早孕。另外，Y染色体异常可能会导致男性的Y精子缺失，从而出现无法生育男孩儿只能生育女孩儿的情况。并且男性Y染色体异常的情况是只遗传男孩，不遗传女孩的，所以即使是生出了男孩儿，男孩儿遗传到染色体异常的概率也非常高。