男方基因突变是可以做第三代试管阻断遗传的。不过目前世界上已知的遗传性疾病有4000多种，而三代试管婴儿可筛查出的基因疾病只有一百多种，并不是所有的疾病都可以筛查出来的，所以如果男方基因突变的问题不在三代试管目前可筛查出的范围内，那么做三代试管也是没有用的。建议各位患者在做三代试管前，先咨询医院再根据自己的实际情况去做选择。

三代试管可以通过PGS筛查技术，筛选出染色体异常的胚胎，移植健康的胚胎到女性体内，从而避免基因突变的发生，阻断遗传性疾病出健康宝宝。以下是目前三代试管可筛查出的遗传疾病，如下：

1. 1. 单基因疾病：单基因遗传病主要包括地中海贫血、色盲症、早衰症、血友病、白化病、视网膜母细胞瘤等，而三代试管婴儿可以排除一些单基因突变的情况；
2. 2. 多基因疾病：第三代试管婴儿可以在胚胎移植前对胚胎进行检测，筛选出健康的胚胎进行移植，防止如精神分裂症、躁狂抑郁性精神病、重症先天性心脏病和原发性癫痫等多基因遗传病的传递；
3. 3. 染色体异常疾病：染色体遗传病主要包括智力低下、特殊面容、发育迟缓、骨骼发育不全、成骨不全、马凡式综合征等，三代试管对胚胎进行挑选之后移植，可以排除后代致病基因的遗传。

总的来说，基因突变问题目前是无法进行治疗的，只有做三代试管才可以避免遗传，阻断遗传疾病的传播。不过由于目前三代试管的费用还是比较高的，并且也不能保证一次性就能成功移植，所以建议各位患者在做试管前一定要做好心理准备，积极配合医生的治疗，一定会好孕的。