夫妻双方基因不合，也还是能生出健康小孩的。不过这种情况的受孕几率较低，也特别容易出现流产、胎停、生化妊娠等情况，并且孩子出生后的发病几率也特别高，所以一般是建议做三代试管进行助孕的。另外，基因不合的夫妻在怀孕后也一定要定期做好产检，避免后代出现染色体异常，导致新生儿出现智力低下以及畸形儿的现象。

由于人的生命活动都是由基因决定的，基因是由父亲提供的精子和母亲提供的卵细胞决定的，如果父母的基因不合，那么就有可能会出现较为严重的问题，如不孕不育、各不同不同形式的疾病、怪异的性格等。以下是夫妻基因不合生下的孩子可能会出现的情况：

1. 1. 不孕不育：可能会因为基因不合而导致夫妻结婚多年都没有办法自然生育，或是怀孕后出现流产、胎停等情况；
2. 2. 血友病：因为夫妻双方基因不合，孩子出生后就很容易出现凝血问题，导致凝血时间延长，终身有轻微损伤或手术后长时间出血的倾向；
3. 3. 胎儿畸形：基因不合也会导致胎儿在生长发育的过程中，出现结构或者功能缺陷，出来的孩子有可能会存在外形畸形、智力低下、癫痫或者语言障碍、行为异常等。

综上所述，夫妻双方基因不合并不建议盲目的要孩子，否则容易导致流产，胎儿比较难以存活，反复流产对母亲身体伤害很大。建议患者先去正规的大型医院通过基因疗法治疗，或是通过第三代试管婴儿进行助孕，从而保障孩子出生后的健康。