子宫内膜异位症是会影响到囊胚移植后着床的。子宫内膜异位症属于一种难治疗的疾病，该症状会破坏卵巢功能，影响排卵，同时也会造成盆腔粘连，导致试管移植困难，即使囊胚移植后成功着床，也会因为子宫环境不佳而无法正常的生长发育，出现囊胚移植后停止发育或出现流产等情况。因此，建议子宫内膜异位患者在试管移植前一定要在医生的指导下进行相应的治疗，避免影响到囊胚移植。

虽然说子宫内膜异位症对囊胚移植影响较大，但影响试管移植的因素有很多，不仅仅只是子宫内膜异位症，还与患者的年龄、胚胎质量、心理状态等有所关系。所以子宫内膜异位患者要想提高囊胚移植后的着床率，可以在移植前通过以下方式调理身体：

1. 1. 适量运动：运动能够有效改善身体素质从而更有利于受孕。多运动对身体好处特别多，除了能够改善身体素质，加快人体血液传输，还可以也可以提高呼吸系统功能，能够调节体内激素分泌水平，可以提高胚胎着床概率；
2. 2. 调理身体：在进行试管助孕前期，一定要调理好身体的状态。对子宫内膜异位症进行相关的干预和治疗，根据病情的具体情况来决定是用药物还是手术进行相关干预。将身体调理到适合妊娠的状态下时，再进行试管助孕，成功率会更高；
3. 3. 饮食改善：患有子宫内膜异位症的女性朋友在饮食上也需要格外注意，平时需要忌食辛辣刺激性寒凉食物，尤其是生理期前后，需要摄入优质蛋白，减少高脂肪、高热量食物。除此以外还需要补充铁，补充膳食纤维，合理饮食有助于病情的恢复，还可降低疾病的复发率；
4. 4. 调整心态：很多女性可能在平时并没有察觉到自己的身体情况出现异常，但在备孕期间却发现久备不孕时，这时难免会感到压力剧增，焦虑，困扰的情绪自然就上升了。其实这种情绪状态下并不利于身体健康，可能影响到身体内激素的分泌，从而影响到身体的健康。

总的来说，患有子宫内膜异位症的患者确实会影响到囊胚移植后的着床率，但只要积极配合医生的治疗，通过以上方法自行调理身体的话，相信好孕并不会太远。