男性9号染色体异常自然受孕后，生出的孩子可能会出现畸形，还可能会出现先天性心脏病、特殊的面容、脑瘫、运动失调等症状。且染色体方面的疾病目前是没有办法治疗的，只能做到缓解症状，所以一般建议染色体异常患者想要生育后代的话，可以通过三代试管婴儿进行助孕，能很大程度上的保证下一代的健康，生出健康宝宝。

正常人体细胞中有23对染色体，具有一定的形状和结构。染色体的形状、结构和数目异常称为染色体异常，由染色体异常引起的疾病称为染色体病，最常见的是21-三体综合征，即先天性痴呆等。而9号染色体异常是纯在遗传性的，当男性9号染色体异常，那么胎儿可能会存在该情况，具体如下：

1. 1. 如果发生了9号染色体条数的异常，例如9号染色体三体或9号染色体单体，这种情况下是严重的染色体畸形，必须要终止妊娠；
2. 2. 如果经过染色体核型分析，发现存在9号染色体平衡易位，这种情况认为是正常的，是一种染色体的多态性，并不会对胎儿的生长发育造成影响；
3. 3. 如果通过基因芯片检测9号染色体存在微缺失或微重复，应该根据具体的数据库以及与父母双方的染色体进行比较，才能决定胎儿的去留。

通常情况下，导致男性9号染色体异常的原因有很多，如男性可能长期处于电离辐射的工作状态，或者有毒作业环境而导致的，还有可能是遗传因素，既然已经发现自己的染色体有异常的现象，一定要进行对症治疗。在备孕前先去医院做全面检查，在医生的指导下科学备孕，在怀孕期间女性还应该定期产检，若胎儿出现异常需及时终止妊娠。同时也可以通过三代试管婴儿助孕，到底优生优育的目的。