不完全纵隔子宫术后自然受孕怀上双胞胎，是有一定风险的。因为不完全纵隔子宫在手术后可能会对宫腔造成一定的损伤，可能会导致女性出现宫腔粘连等情况，且双胎妊娠本就比单胎妊娠的风险大，此时若是怀上双胞胎，可能会影响胎儿的生长发育，出现流产、胎停、连体婴儿等情况。不过毕竟每个女性的身体情况不同，术后的恢复效果不同，建议女性怀孕后定期前往医院检查，若出现异常需及时治疗，必要时需在医生的指导下进行减胎，确保自身和胎儿的健康。

其实，不管是正常女性还是患有不完全纵隔子宫的女性，双胎妊娠的风险都是比单胎妊娠的风险大的。因为怀上双胞胎，对子宫的压力会明显增加，这会在不同程度上加重母体的负担。下面就手术纵隔子宫术后怀双胎有什么风险，如下：

1. 1. 早产：双胎妊娠由于子宫张力大，容易发生胎膜早破和早产，早产率接近50％。早产，尤其是孕34周前的早产儿，可能会出现肺透明膜病变、缺氧缺血性脑病、DIC、甚至围产儿死亡；
2. 2. 自然流产：双胎妊娠中自然流产的发生率为单胎妊娠的2倍。因此建议每个育龄妇女一旦获知已经受孕，应及时行超声检查，确定胎儿数量，必要时可在医生的建议下进行减胎手术；
3. 3. 胎儿发育不良：即使做完不完全纵隔子宫术后，子宫的容量也是有限的，尤其是身材矮小、肥胖、瘦弱的孕妇，有限的空间和营养供给，势必造成两个胎儿均发育迟缓，胎儿发生缺氧、新生儿脑瘫的机率明显升高。

综上所述，虽然不完全纵隔子宫术后，受精卵一般能够正常着床、生长发育，通常不会存在风险。但双胎妊娠的话，还是有很大风险的，且还容易出现严重的胎儿并发症，如双胎输血综合症、选择性胎儿发育迟缓、双胎贫血-多血质综合症、双胎反向灌注综合症等。因此，女性在孕期一定要按时产检，适当增加产检的次数，并注意休息以及加强饮食营养，这样才有助于顺利度过妊娠期，生出健康宝宝。